Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cd40lgP27548 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd40lgP27548 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms