Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rps6ka3P18654 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rps6ka3P18654 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms