Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18528 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18528 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18528 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18528 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18528 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18528 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18528 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18528 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18528 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18528 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18528 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18528 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
P18528 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
P18528 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
P18528 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
P18528 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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