Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rag1P15919 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rag1P15919 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Rag1P15919 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms