Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Irf1P15314 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms