Protein–RNA interactions for Protein: P03911

Mtnd4, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd4P03911 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mtnd4P03911 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms