Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt10P02535 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt10P02535 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt10P02535 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt10P02535 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt10P02535 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt10P02535 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Krt10P02535 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt10P02535 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt10P02535 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt10P02535 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt10P02535 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt10P02535 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Krt10P02535 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms