Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
P01822 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01822 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01822 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01822 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01822 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01822 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01822 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01822 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01822 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01822 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01822 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01822 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01822 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P01822 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01822 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01822 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01822 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01822 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01822 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
P01822 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01822 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01822 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01822 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01822 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01822 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01822 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01822 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01822 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01822 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01822 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01822 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01822 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01822 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01822 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01822 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01822 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01822 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01822 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01822 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01822 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01822 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01822 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01822 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01822 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01822 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01822 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01822 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01822 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01822 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01822 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01822 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01822 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01822 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01822 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms