Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01641 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
P01641 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01641 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
P01641 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01641 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
P01641 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01641 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01641 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01641 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01641 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01641 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01641 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01641 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
P01641 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01641 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01641 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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P01641 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01641 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01641 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01641 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01641 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01641 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01641 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01641 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
P01641 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
P01641 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01641 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
P01641 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01641 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01641 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01641 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01641 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01641 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms