Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CntfrO88507 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CntfrO88507 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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