Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dync1i1O88485 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dync1i1O88485 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dync1i1O88485 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dync1i1O88485 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dync1i1O88485 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dync1i1O88485 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dync1i1O88485 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dync1i1O88485 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dync1i1O88485 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dync1i1O88485 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dync1i1O88485 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dync1i1O88485 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dync1i1O88485 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dync1i1O88485 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dync1i1O88485 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms