Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cacna1bO55017 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms