Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf13O54965 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf13O54965 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf13O54965 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf13O54965 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf13O54965 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf13O54965 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf13O54965 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rnf13O54965 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms