Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tnfrsf18O35714 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tnfrsf18O35714 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms