Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Atf6bO35451 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Atf6bO35451 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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