Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Bhlhe40O35185 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms