Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
MsmbO08540 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
MsmbO08540 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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