Protein–RNA interactions for Protein: L7N291

Gm8857, Predicted gene 8857 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8857L7N291 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm8857L7N291 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms