Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC8.4□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm7340-201ENSMUST00000119729 2752 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm44914-201ENSMUST00000207191 2720 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm8089-201ENSMUST00000122463 968 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm24111-201ENSMUST00000175491 97 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm37751-201ENSMUST00000192440 1198 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm45078-201ENSMUST00000205343 546 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Higd1a-202ENSMUST00000213124 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ms4a2-202ENSMUST00000164792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm33112-201ENSMUST00000193971 699 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 D530037P16Rik-201ENSMUST00000199255 1027 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 4922502N22Rik-201ENSMUST00000204038 1149 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Gm21887J3QQ04 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms