Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP8

Gm21863, Predicted gene, 21863, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21863J3KMP8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21863J3KMP8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Gm21863J3KMP8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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