Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ccdc171E9Q1U1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ccdc171E9Q1U1 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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