Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
2610021A01RikE9Q0Q3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms