Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccdc170D3YXL0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc170D3YXL0 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms