Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Uhrf1bp1B2KF50 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Uhrf1bp1B2KF50 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Uhrf1bp1B2KF50 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms