Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Samt1A2BED8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Samt1A2BED8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms