Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CtcflA2APF3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CtcflA2APF3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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