Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Calcoco2A2A6M5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Calcoco2A2A6M5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms