Protein–RNA interactions for Protein: A1L3C1

Fam71e1, Protein FAM71E1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71e1A1L3C1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Gm16833-202ENSMUST00000189204 672 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71e1A1L3C1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Fam71e1A1L3C1 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms