Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AL442071.1-201ENST00000289890 558 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 XAGE3-201ENST00000346279 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 RNU2-50P-201ENST00000410494 143 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 GNRHR-202ENST00000420975 859 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 LINC01449-201ENST00000440213 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AKR1D1P1-201ENST00000457236 936 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC022206.1-201ENST00000495947 347 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 CRYAB-205ENST00000526180 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 RPL27A-210ENST00000531978 867 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC130404.1-201ENST00000539362 739 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 TMEM191C-213ENST00000545656 574 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC009729.1-201ENST00000548873 1133 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AL008723.3-201ENST00000608926 449 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 OR5B2-201ENST00000302581 1049 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 CEACAM1-208ENST00000403461 1263 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 RPL23AP85-201ENST00000421838 433 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC023271.1-201ENST00000445936 1090 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 LINC02502-201ENST00000505122 642 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC068721.1-201ENST00000507156 583 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 NR1I3-229ENST00000511748 480 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 NPIPB1P-201ENST00000547442 1129 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC022872.1-201ENST00000568391 781 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC012254.2-203ENST00000588705 561 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 NPIPB1P-202ENST00000588786 828 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 LAMTOR5-AS1-227ENST00000609653 457 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
CCBE1Q6UXH8 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
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