Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

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Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 NRXN1-211ENST00000406859 2553 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 LINC01362-202ENST00000452901 1712 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 C5orf51-204ENST00000612065 1391 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 THADA-207ENST00000405975 6114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 THAP12P9-201ENST00000503971 2360 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 MFSD8-217ENST00000641178 4374 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC010551.2-201ENST00000569200 416 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 MIR5095-201ENST00000578844 88 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
SREBF2Q12772 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 PARP4P1-201ENST00000435945 2337 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC096711.3-201ENST00000420721 582 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LINC02224-201ENST00000505706 584 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC005832.1-201ENST00000544380 572 ntTSL 4 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LINC01587-204ENST00000623565 873 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 MUC5AC-201ENST00000621226 17448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 MC4R-201ENST00000299766 1666 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LRMDA-208ENST00000496424 3923 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC105749.1-201ENST00000631338 2008 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 OR56B1-201ENST00000317121 2075 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 ATF7IP-201ENST00000261168 8878 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SREBF2Q12772 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
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