Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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PGGT1BP53609 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
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PGGT1BP53609 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
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PGGT1BP53609 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PGGT1BP53609 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PGGT1BP53609 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 TMBIM4-203ENST00000398033 844 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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PGGT1BP53609 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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PGGT1BP53609 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
PGGT1BP53609 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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