Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 LINC02112-203ENST00000606169 419 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 MIR4435-2HG-219ENST00000609220 883 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AL122125.1-201ENST00000616999 600 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC103564.3-201ENST00000621194 220 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 CASC8-203ENST00000502082 1420 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 C11orf54-206ENST00000528099 1862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 ZNF568-214ENST00000616085 3542 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 DNAH6-202ENST00000389394 12795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 RN7SKP191-201ENST00000364713 306 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC007879.3-201ENST00000417096 556 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 LINC01789-201ENST00000443123 860 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC068491.1-201ENST00000449539 1241 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 HIGD1AP16-201ENST00000450986 258 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC011625.1-201ENST00000455442 526 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC137549.1-201ENST00000514243 533 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC079064.1-201ENST00000528365 362 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 PATE4-203ENST00000534411 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC020892.1-201ENST00000559918 855 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC105243.1-201ENST00000563172 1165 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 FCGR1CP-201ENST00000579737 1127 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AL137000.1-201ENST00000610528 1244 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
VAX2Q9UIW0 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
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