Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC003045.1-201ENST00000398779 713 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL137847.1-201ENST00000416473 444 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL031681.1-201ENST00000443304 400 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MTND6P5-201ENST00000448266 512 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PEX5L-AS2-201ENST00000462801 630 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC104164.3-201ENST00000467363 1258 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL326P-201ENST00000477493 296 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL158058.1-201ENST00000549515 647 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC013640.1-201ENST00000565366 565 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MIR212-201ENST00000586026 110 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LIPF-205ENST00000608620 1290 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL445528.2-201ENST00000620582 470 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC099329.1-203ENST00000629885 767 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC217777.1-201ENST00000570034 1471 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RBMS1-203ENST00000409075 1550 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 ZNF669-202ENST00000366500 489 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 LINC00352-201ENST00000425800 552 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL354989.1-201ENST00000448245 635 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL445238.1-201ENST00000450029 712 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
SH3BP4Q9P0V3 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms