Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 SDC4P-201ENST00000453285 601 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 RPL7L1P3-201ENST00000455249 689 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 SEMA6A-AS1-202ENST00000508424 862 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 TAT-AS1-201ENST00000561529 873 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 CYCSP1-201ENST00000604815 315 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 RAD17P2-201ENST00000451754 1977 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 BLOC1S2-205ENST00000614731 2634 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 PTPRG-AS1-204ENST00000474795 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 CDKN3-203ENST00000395577 637 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 LINC01809-201ENST00000448431 303 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 THOC7-AS1-201ENST00000468961 673 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC025366.1-201ENST00000523264 202 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 OR6C68-201ENST00000548615 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC020978.7-201ENST00000575953 1187 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC007423.1-201ENST00000605009 627 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
CTXN3Q4LDR2 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
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