Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 GMDS-AS1-212ENST00000534160 720 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC008536.1-201ENST00000602872 669 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC015849.6-201ENST00000605454 474 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 BIRC3-207ENST00000615299 4342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 SOX2-OT-218ENST00000498731 3576 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 SLC10A7-202ENST00000394059 1730 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC114876.1-201ENST00000490962 1366 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RNU11-6P-201ENST00000391127 133 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL132875.1-201ENST00000403623 949 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC008080.2-201ENST00000455149 577 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC018607.1-201ENST00000518552 673 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC090150.1-201ENST00000521408 585 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AL133243.2-201ENST00000610331 1621 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC007342.5-201ENST00000571340 2142 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 CCNT2P1-201ENST00000423082 1315 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RN7SKP151-201ENST00000410230 316 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LRRTM2O43300 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms