Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 ZNF652-201ENST00000362063 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTS3-204ENST00000622135 4479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 RGS1-201ENST00000367459 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 ZNF3-203ENST00000303915 3473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC012618.3-201ENST00000415793 2042 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC019197.1-202ENST00000414885 2639 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 MTMR7-201ENST00000180173 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 OR13C1P-201ENST00000457612 963 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC008115.4-201ENST00000619780 775 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 OR7A17-202ENST00000641113 3639 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 DPCR1-201ENST00000304311 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 SHQ1P1-201ENST00000437111 1544 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AL117339.5-201ENST00000640275 3955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 ZNF329-204ENST00000598312 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AP002364.1-201ENST00000623330 3386 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 FO393409.1-201ENST00000399325 1372 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 NAT1-206ENST00000518029 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 HIST1H1T-201ENST00000338379 718 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 U3.43-201ENST00000410734 213 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 TEX50-201ENST00000417563 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 RPL5P2-201ENST00000429598 854 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 AC006947.1-201ENST00000457168 484 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
ZNRF3Q9ULT6 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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