Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 FGL2-201ENST00000248598 4261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AP000619.2-201ENST00000546014 969 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 APBB2-230ENST00000543538 6992 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
CTNNA3Q9UI47 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.7 ms