Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 CLPS-201ENST00000259938 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 TMEM67-205ENST00000453321 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 HNRNPRP2-201ENST00000528421 743 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 LINC00343-202ENST00000415294 1320 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 BLOC1S6-209ENST00000565409 616 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 THCAT158-201ENST00000575039 535 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
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