Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PCAT5-201ENST00000626667 3550 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CACNB1Q02641 RBM17-205ENST00000446108 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CACNB1Q02641 CAPN11-201ENST00000398776 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CACNB1Q02641 AP001120.1-201ENST00000561598 3710 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CACNB1Q02641 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CACNB1Q02641 EIF1AD-201ENST00000312234 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CACNB1Q02641 MOBP-202ENST00000383754 3051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CACNB1Q02641 EXOSC10-202ENST00000376936 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 TRIM55-201ENST00000276573 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 VWA5A-204ENST00000449321 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 TRPC3-201ENST00000264811 3675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 BLOC1S6-201ENST00000220531 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC007608.1-201ENST00000379963 2469 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 MAP3K7CL-202ENST00000339024 2066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 POU6F2-210ENST00000559001 2403 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC092373.1-201ENST00000414951 490 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC092035.1-201ENST00000418538 390 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC104794.1-201ENST00000425235 312 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AL023653.1-201ENST00000432513 326 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AL139327.3-201ENST00000433721 379 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 CHCHD4P3-201ENST00000455954 410 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC005550.2-201ENST00000476382 318 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AL449212.1-201ENST00000499853 517 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC105416.1-201ENST00000506991 842 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 IGHV7-27-201ENST00000522512 330 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 BAALC-AS1-208ENST00000523614 582 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC068152.1-203ENST00000570314 254 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 MIR6785-201ENST00000618984 81 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 TDRD3-202ENST00000377881 2532 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC108451.1-201ENST00000558208 2520 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 TAOK1-201ENST00000261716 12407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 FZD6-201ENST00000358755 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 LINC01998-201ENST00000464673 1967 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 MYH1-201ENST00000226207 6024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 ZNF780A-201ENST00000340963 3674 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 ZNF160-214ENST00000601421 4688 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 NLRP1-215ENST00000613500 4494 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 ATP5G3-201ENST00000284727 5484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 ATP9A-201ENST00000311637 7437 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 ZNF442-201ENST00000242804 6219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 MAT2A-201ENST00000306434 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 KRIT1-202ENST00000394503 2827 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 EMP1-201ENST00000256951 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 MCTP1-204ENST00000505078 2629 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 PARP6-223ENST00000616176 2102 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 FAM20A-207ENST00000619787 2798 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 PCSK2-201ENST00000262545 4740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 DDX11-202ENST00000350437 3724 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 OR2A4-201ENST00000315453 1758 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 LCT-201ENST00000264162 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 TRIM23-201ENST00000231524 4186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 MIR5689HG-201ENST00000366312 656 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 RPL9P21-201ENST00000392269 505 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC021028.1-201ENST00000417559 598 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC084851.3-201ENST00000432771 573 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC105393.1-202ENST00000449621 598 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC018638.2-201ENST00000471258 403 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC073111.1-201ENST00000497366 420 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC233724.11-201ENST00000508480 404 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC093281.1-201ENST00000514239 549 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 GAPDHP70-201ENST00000515281 1045 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 IGLVIV-64-201ENST00000518581 301 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 AC002070.1-201ENST00000537366 693 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 LRRC37A13P-201ENST00000546055 287 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
CACNB1Q02641 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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