Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC108727.2-201ENST00000512277 392 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC018767.2-201ENST00000562361 600 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC007639.1-201ENST00000577281 833 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 OBSCN-201ENST00000284548 20432 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 TMEM244-202ENST00000438392 565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 LINC02492-201ENST00000502952 564 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL365181.4-201ENST00000609800 547 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 AL442128.2-201ENST00000620246 1824 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COPS7AQ9UBW8 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms