Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC093801.1-201ENST00000504017 307 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC004232.2-201ENST00000574245 821 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AL050403.2-203ENST00000603180 558 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AL137071.1-201ENST00000422150 243 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RBMY2BP-202ENST00000451071 1156 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 DEFB109A-201ENST00000482450 265 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 NACAP5-201ENST00000509863 636 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC096576.2-201ENST00000511835 948 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 C5orf46-203ENST00000515291 573 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC010401.3-201ENST00000576600 582 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC243967.1-201ENST00000598976 578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 CPB2-AS1-201ENST00000415033 747 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 NAV2-IT1-201ENST00000528204 506 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
TRAM2Q15035 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms