Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 SEM1-202ENST00000356686 2667 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CDY17P-201ENST00000414121 1282 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL603840.1-203ENST00000424357 645 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL353608.2-201ENST00000425587 340 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RPL36AP39-201ENST00000445859 318 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 TFDP2-211ENST00000479040 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 ZNF605-204ENST00000392321 6156 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 PEX5L-AS1-201ENST00000466064 827 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC090403.1-202ENST00000582108 833 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
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