Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ST7-204ENST00000393444 2113 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 BX470102.1-201ENST00000420695 531 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 CRNDE-201ENST00000501177 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC008521.2-201ENST00000591021 259 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC112493.1-201ENST00000609836 303 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 RNF19BPY-201ENST00000458209 1550 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 NBPF9-203ENST00000610300 2930 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 SV2B-202ENST00000394232 11279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 NAT2-201ENST00000286479 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
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PTPRCP08575 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 LINC01203-201ENST00000419566 580 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 RPL31P15-201ENST00000449770 338 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC027343.2-201ENST00000513219 343 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC127024.6-201ENST00000621598 424 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.25
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