Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC012668.2-201ENST00000431727 503 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AL353751.1-203ENST00000437032 603 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 RNU6-964P-201ENST00000516524 69 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC139099.3-202ENST00000574856 439 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 SLC9B1P1-201ENST00000331172 1337 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC020743.2-201ENST00000639870 1370 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 PRSS37-201ENST00000350549 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC139720.1-201ENST00000509497 512 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 TMSB4XP2-201ENST00000335179 210 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCSER1Q9C0I3 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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