Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC073342.3-201ENST00000624211 193 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC084816.1-204ENST00000628326 631 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 SNW1-204ENST00000554775 1687 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 EPS15P1-202ENST00000459691 2071 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC008040.1-202ENST00000483289 6251 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 RPGRIP1L-206ENST00000564374 3877 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 RRN3-202ENST00000327307 2039 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC016251.2-201ENST00000623393 3089 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC068490.1-202ENST00000637384 3185 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 TSACC-201ENST00000368251 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 CEACAM7-202ENST00000401731 1236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 LINC01214-201ENST00000471222 335 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 STRADBP1-201ENST00000478954 1281 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 NPM1P27-201ENST00000502784 830 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC084337.1-201ENST00000524809 686 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AP000873.2-203ENST00000528524 549 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AP000851.1-202ENST00000542119 743 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC084759.1-201ENST00000561168 290 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AL353804.2-201ENST00000603360 347 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC006924.1-201ENST00000610750 559 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AL136359.1-201ENST00000625090 565 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 CD209-203ENST00000315599 4283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 CSNK2A1-204ENST00000400227 1499 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 KIAA1549L-202ENST00000321505 11678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 ZNF83-205ENST00000594682 2890 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 BCO2-214ENST00000532593 1647 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
FSCN1Q16658 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms