Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ITSN1-206ENST00000381318 17015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ATP13A5-201ENST00000342358 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 IPO5-222ENST00000490680 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 KCNJ15-220ENST00000612702 3046 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 LINC01616-201ENST00000561816 2280 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 APOOL-202ENST00000613473 6445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC090592.1-202ENST00000533049 568 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 KLF18-201ENST00000634670 3159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 FOXJ3-204ENST00000372572 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AL031651.1-201ENST00000615357 1438 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC008957.3-201ENST00000624112 2242 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 CD109-201ENST00000287097 9130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RN7SL165P-201ENST00000477476 291 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 LINC02218-201ENST00000503267 529 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 BMPR1APS2-201ENST00000527904 1012 ntBASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 IARS-202ENST00000375643 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 GABRR1-206ENST00000611484 3259 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 TRRAP-202ENST00000359863 12677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ZFAND1-208ENST00000519523 698 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AL445465.1-206ENST00000609544 528 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RAB14-201ENST00000373840 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AL391261.1-201ENST00000555712 1479 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AL360081.1-201ENST00000428299 555 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
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