Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC093297.3-201ENST00000607056 2517 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 VEZF1-204ENST00000584396 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 OR10T1P-201ENST00000424327 947 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC002056.2-201ENST00000532913 284 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CTLA4P16410 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ZNF431-201ENST00000311048 13894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 CCAT2-201ENST00000630920 1752 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 MT4-201ENST00000219162 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 LINC01593-201ENST00000424355 388 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 MRPS21P3-201ENST00000436696 262 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 CTSLP6-201ENST00000458273 1002 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC073610.1-201ENST00000489971 396 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC109466.1-215ENST00000519750 516 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC078820.1-201ENST00000548702 742 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 AC023310.2-201ENST00000553844 547 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CTLA4P16410 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
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