Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ASNSD1-208ENST00000607690 535 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC092574.2-201ENST00000631198 753 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 NUMB-201ENST00000355058 3342 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC096921.2-201ENST00000561507 1916 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 NAV1-201ENST00000367295 11645 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 CACNB4-234ENST00000636785 3787 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 SAMD13-204ENST00000370671 724 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL355143.1-201ENST00000407101 841 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 IPPKP1-201ENST00000422501 768 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RPL6P30-201ENST00000443382 862 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC01952-202ENST00000450016 281 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC116634.1-201ENST00000506926 447 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RNA5SP400-201ENST00000517155 111 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC022826.1-201ENST00000519383 805 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC073941.1-201ENST00000559148 539 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 CT45A1-201ENST00000594117 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
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CCDC142Q17RM4 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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CCDC142Q17RM4 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 SULT6B1-201ENST00000407963 902 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
CCDC142Q17RM4 AC007283.1-201ENST00000434645 445 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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