Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 KRBOX1-202ENST00000418176 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 CACNB2-207ENST00000377329 3396 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 OR6J1-201ENST00000540461 4165 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ZNF790-206ENST00000613249 2183 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 GRIA2-204ENST00000393815 5260 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC068535.1-201ENST00000416008 471 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AP000365.1-201ENST00000438850 546 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC139493.1-201ENST00000604368 397 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ZNF329-203ENST00000597186 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ITPR1-201ENST00000302640 10197 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.79□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
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VPS72Q15906 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC073916.1-201ENST00000545095 130 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ANKS1B-207ENST00000546960 1383 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 CCDC129-211ENST00000615280 4142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
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VPS72Q15906 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 UG0898H09-202ENST00000623646 7040 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 PYGO1-202ENST00000563719 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 PLCH1-AS1-201ENST00000475196 1308 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MAPK10-341ENST00000641657 3860 ntAPPRIS P2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 MEIS1-209ENST00000488550 5111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
VPS72Q15906 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 CNTNAP4-206ENST00000478060 3708 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 FO082842.1-201ENST00000423552 1370 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
VPS72Q15906 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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