Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 ACSL5-203ENST00000356116 3353 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 ZRANB3-202ENST00000401392 6820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AC108449.2-201ENST00000560865 552 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 OR51I2-202ENST00000641930 3302 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 DIS3-201ENST00000377767 10604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 SMG1-202ENST00000446231 16115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 SSX1-201ENST00000376919 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 TRPC4-204ENST00000379673 2760 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 EIF2S2P3-201ENST00000428356 999 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 APELA-202ENST00000507152 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 LINC01493-201ENST00000530102 460 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AC137768.1-201ENST00000549998 553 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 TCL6_3.1-201ENST00000619064 137 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 CPSF6-202ENST00000435070 6616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 ABLIM1-214ENST00000533213 7606 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 HYDIN-206ENST00000393567 15719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 ZNF385B-201ENST00000336917 2610 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 PLXNC1-205ENST00000547057 2455 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 SPRYD4-201ENST00000338146 10779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 ZNF177-202ENST00000589262 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AC021351.1-202ENST00000561394 701 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AC012593.1-212ENST00000627058 580 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC8.96□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 REV3L-203ENST00000368805 10461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.97
PTPRGP23470 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 OSGEPL1-207ENST00000522700 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 MDM4-217ENST00000621032 5592 ntTSL 2 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 LPA-201ENST00000316300 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AL022319.1-201ENST00000458183 1167 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 LINC02035-201ENST00000610128 5476 ntBASIC8.96□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 GRIK2-205ENST00000369138 4921 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 CAPS2-205ENST00000409445 2135 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 AC002090.1-201ENST00000625000 2138 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
PTPRGP23470 SGIP1-201ENST00000237247 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.6 ms